威海市住房公积金管理中心内设办公室、计划会计科、信息技术科、稽查科、征收管理办公室、贷款科、客户服务中心、营业部、财务科、政工科、调研科11个科室，下设市区、高区、经区、临港区、荣成、文登、乳山以及石岛8个管理部，全市实行“统一管理、统一决策、统一制度、统一核算”。